画面の一部にのみモザイク処理の出来るビデオ編集ソフトが欲しいです。
ご存知の方は教えてください。

エッチなビデオみたいにですか？
普通のビデオ編集ソフトだと難しいですね。
アフターエフェクツでモザイクをかけたビデオの上にモザイクなしのビデオを重ねて，
一部分だけ切り抜けば上手くできると思います。
他にも，カノープスのビデオ編集ソフトがモザイク処理が得意との話を聞いたことがあります。
アドビとカノープスに問い合わせてみてはどうでしょうか。

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